非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳:
1 儀器:垂直系列電泳槽;低、中、高壓電源;恒溫循環(huán)器
2 試劑: 丙烯酰胺、甲叉雙丙烯酰胺、過硫酸銨、TEMED、 考馬斯亮藍(lán)\硝酸銀、凝膠緩沖液、非變性上樣緩 沖液、Tris堿、甘氨酸等
聚丙烯酰胺凝膠電泳
變性聚丙烯酰胺凝膠電泳 1 儀器:垂直系列電泳槽;低、中壓電源、恒溫循環(huán)器 2 試劑: 丙烯酰胺、N,N’-甲叉雙丙烯酰胺, SDS( 十二烷基硫 酸鈉)溶液、1.5MTris-HCl(pH8.8)、0.5MTris- HCl(pH6.8)、TEMED、10%(w/v)過硫酸胺溶液、SDS- Page上樣緩沖液:( 0.5M Tris( pH6.8)緩沖液、甘油、 10%SDS 、二硫蘇糖醇、溴酚藍(lán))、Tris、甘氨酸、SDS 、考馬斯亮藍(lán) \硝酸銀等
SDS-Page,在蛋白質(zhì)裂解液中加入 SDS和疏基乙醇或DTT
巰基乙醇或DTT可使蛋白質(zhì)分子中二硫鍵還原,使多肽分成單個亞單位。
SDS-PAGE時,在蛋白質(zhì)裂解液中加入SDS和疏基乙醇或DTT
PAGE據(jù)其有無濃縮效應(yīng),分為連續(xù)系統(tǒng)與不連續(xù)系統(tǒng)
連續(xù)系統(tǒng)電泳體系中緩沖液pH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電場作用下,主要靠電荷及分子篩效應(yīng); 不連續(xù)系統(tǒng)電泳體系中由于緩沖液離子成分、pH、凝膠濃度及電位梯度的不連續(xù)性,帶電顆粒在電場中泳動不僅有電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng),還具有濃縮效應(yīng),故分離效果更好。 不連續(xù)的聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì),利用凝膠層的不連續(xù)性、緩沖液離子的不連續(xù)性、PH的不連續(xù)性及電位梯度的不連續(xù)性,使樣品在不連續(xù)的兩相間積聚濃縮成很薄的起始區(qū)帶,然后進(jìn)行分離。
樣品濃縮效應(yīng)
1) 凝膠孔徑的不連續(xù)性: 濃縮膠為大孔膠;分離膠為小孔膠。在電場作用下,樣品顆粒在 大孔膠中泳動的阻力小,移動速度快;當(dāng)進(jìn)入小孔膠時,受到的阻 力大,移動速度減慢。因而在兩層凝膠交界處,樣品遷移受阻而壓 縮成很窄的區(qū)帶。
2) 電位梯度的不連續(xù)性: 電泳開始后,快離子的快速移動會在其后形成一個離子強度很低 的低電導(dǎo)區(qū),使局部電位梯度增高,將蛋白質(zhì)濃縮成狹窄的區(qū)帶
緩沖體系離子成分及pH值的不連續(xù)性
Tris:緩沖配對離子,維持溶液的電中性及pH值 Cl-: 在電場中遷移率快,前導(dǎo)離子(leading ion),快離子。 Gly:其pI =6.0,在pH6.8的濃縮膠緩沖體系中,甘氨酸解離度很小,因而在 電場中遷移很慢,稱為尾隨離子(trailing ion),慢離子。當(dāng)進(jìn)入 pH8.8的分離膠時,甘氨酸解離度增加,其有效遷移率超過蛋白質(zhì);因此 Cl-及NH2CH2COO-沿著離子界面繼續(xù)前進(jìn)。高電勢梯度不存在了,各種蛋 白質(zhì)僅會由于其分子量或構(gòu)型的不同,在一個均一的電勢梯度和pH條件 下通過一定孔徑的分離膠時所受阻滯的程度不同,表現(xiàn)的泳動率的不同 被分開 大多數(shù)蛋白質(zhì)在pH6.7或8.3時均帶負(fù)電荷,在電場中,都向正極移動。
分子篩效應(yīng)
大小和形狀不同的蛋白質(zhì)通過一定孔徑分離膠時,受阻滯的程度不同而表現(xiàn)出不同的遷移率 ,這就是分子篩效應(yīng)。
電荷效應(yīng)
蛋白質(zhì)樣品在界面處被濃縮成一狹窄的高濃度蛋白質(zhì)區(qū),但由于每種蛋白質(zhì)分子所帶有效電荷不同,因而泳動率也不同,因此各種蛋白質(zhì)就按泳動率快慢順序排列成一個一個區(qū)帶。在進(jìn)入分離膠時,電荷效應(yīng)仍起作用。 目前,PAGE連續(xù)體系應(yīng)用也很廣,雖然電泳過程中無濃縮效應(yīng),但利用分子篩及電荷效應(yīng)也可使樣品得到較好的分離,加之在溫和的pH條件下,不致使蛋白質(zhì)、酶、核酸等活性物質(zhì)變性失活,也顯示了它的優(yōu)越性。
PAGE電泳據(jù)電泳裝置不同分為圓盤及垂直的板狀兩種
前者凝膠是在玻璃管中聚合,樣品分離區(qū)帶染色后呈圓盤狀,因而稱為圓盤電泳; 后者凝膠是在兩塊間隔幾毫米的平行玻璃板中聚合,故稱為垂直板狀電泳。兩者電泳原理完全相同。
蛋白質(zhì)進(jìn)行PAGE時,常用垂直板電泳。
垂直板電泳的優(yōu)越性有:
表面積大而薄,便于通冷卻水以降低熱效應(yīng),條帶更清晰。
在同一塊膠板上可同時進(jìn)行10個以上樣品的電泳,便于在同一條件下比較分析鑒定,還可用于印跡轉(zhuǎn)移電泳及放射自顯影。
膠板制作方便,易剝離,樣品用量少,分辨率高,不僅可用于分析,還可用于制備。
膠板薄而透明,電泳染色后可制成干板,便于長期保存與掃描。
可進(jìn)行雙向電泳。